兩岸企業(yè)家峰會(huì)發(fā)端于江蘇省南京市，在國務(wù)院臺(tái)辦和江蘇省委、省政府的大力支持下，圍繞深化寧臺(tái)經(jīng)貿(mào)合作和推動(dòng)企業(yè)轉(zhuǎn)型升級(jí)主題，南京市政府分別于2008年、2010年、2011年和2012年成功舉辦四屆海峽兩岸企業(yè)家紫金山峰會(huì)，受到了兩岸各界的廣泛關(guān)注。隨著兩岸關(guān)系和平發(fā)展不斷鞏固深化，兩岸經(jīng)濟(jì)界迫切需要成立一個(gè)最具權(quán)威性、開放性、務(wù)實(shí)性的高端交流合作平臺(tái)。在2012年的海峽兩岸企業(yè)家紫金山峰會(huì)上，與會(huì)政經(jīng)產(chǎn)學(xué)界人士發(fā)布共同倡議，建議在兩岸分別成立兩岸企業(yè)家峰會(huì)社團(tuán)，除每年輪流在大陸及臺(tái)灣舉行年會(huì)之外，根據(jù)兩岸企業(yè)界的實(shí)際需求設(shè)立產(chǎn)業(yè)合作推進(jìn)小組，開展常態(tài)化的交流，以具體務(wù)實(shí)的方式推動(dòng)兩岸企業(yè)的交流合作和融合發(fā)展。

　　在兩岸雙方的共同努力下，2013年7月，經(jīng)中央批準(zhǔn)，民政部注冊(cè)，大陸兩岸企業(yè)家峰會(huì)社團(tuán)在北京市成立。同年7月，臺(tái)灣兩岸企業(yè)家峰會(huì)社團(tuán)在臺(tái)北市成立，300多位兩岸知名企業(yè)家和工商團(tuán)體負(fù)責(zé)人分別加入各自峰會(huì)成為會(huì)員，選舉產(chǎn)生雙方峰會(huì)領(lǐng)導(dǎo)機(jī)構(gòu)。曾培炎、蕭萬長分別當(dāng)選雙方峰會(huì)理事長，盛華仁、江丙坤分別擔(dān)任雙方峰會(huì)副理事長。兩岸峰會(huì)理事會(huì)分別下設(shè)宏觀經(jīng)濟(jì)、能源石化裝備、金融、信息家電、成長型和中小企業(yè)、文化創(chuàng)意、生物科技與健康照護(hù)等七個(gè)產(chǎn)業(yè)合作推進(jìn)小組，由兩岸相關(guān)主管部門前負(fù)責(zé)人和知名企業(yè)家擔(dān)任召集人，開展經(jīng)常性的交流互訪和產(chǎn)業(yè)對(duì)接活動(dòng)。至此，峰會(huì)與兩岸經(jīng)貿(mào)文化論壇、兩會(huì)商談、海峽論壇并列為兩岸四大交流合作平臺(tái)，成為以兩岸企業(yè)家為主體，以匯聚企業(yè)家智慧、加強(qiáng)對(duì)話交流、深化產(chǎn)業(yè)合作為特色的兩岸企業(yè)界最有影響的交流平臺(tái)。雙方商定，峰會(huì)年會(huì)在大陸和臺(tái)灣輪流舉辦，南京市為峰會(huì)年會(huì)大陸永久舉辦地。

　　峰會(huì)的成立，是我們抓住兩岸和平發(fā)展歷史機(jī)遇，順應(yīng)民心潮流、擴(kuò)大交流合作、促進(jìn)融合發(fā)展、推進(jìn)國家統(tǒng)一推出的一項(xiàng)重要制度安排。2013年，習(xí)近平總書記在會(huì)見蕭萬長時(shí)強(qiáng)調(diào)， 要加強(qiáng)兩岸經(jīng)濟(jì)合作制度化建設(shè)，更加重視促進(jìn)產(chǎn)業(yè)合作，積極評(píng)價(jià)兩岸企業(yè)家峰會(huì)為兩岸企業(yè)和經(jīng)濟(jì)界人士搭建的交流對(duì)話高端平臺(tái)，希望雙方共同努力把峰會(huì)辦好。

　　2018年7月18日，兩岸企業(yè)家峰會(huì)大陸方面第二屆會(huì)員大會(huì)在人民大會(huì)堂成功召開。大會(huì)選舉產(chǎn)生了新一屆常務(wù)理事會(huì)及領(lǐng)導(dǎo)機(jī)構(gòu)，十八屆中共中央政治局委員、北京市委原書記郭金龍擔(dān)任峰會(huì)理事長，十二屆全國人大常委會(huì)副委員長張平擔(dān)任峰會(huì)副理事長。經(jīng)雙方商定，峰會(huì)下設(shè)機(jī)構(gòu)調(diào)整為綜合合作交流、能源及環(huán)保節(jié)能、智能制造及裝備、信息、中小企業(yè)合作及青年創(chuàng)業(yè)、金融、現(xiàn)代服務(wù)業(yè)及文化創(chuàng)意、生物科技與健康照護(hù)等八個(gè)產(chǎn)業(yè)合作推進(jìn)小組，以適應(yīng)新形勢下的兩岸經(jīng)濟(jì)發(fā)展和產(chǎn)業(yè)合作需求。 2021年9月9日，兩岸企業(yè)家峰會(huì)臺(tái)灣方面在臺(tái)北召開第三屆第一次會(huì)員大會(huì)，選舉劉兆玄擔(dān)任理事長，蕭萬長擔(dān)任名譽(yù)理事長，陳瑞隆和郭臺(tái)銘擔(dān)任副理事長。

　　兩岸企業(yè)家峰會(huì)社團(tuán)自成立以來，秉持“推動(dòng)兩岸企業(yè)家之間的交流，推進(jìn)兩岸產(chǎn)業(yè)合作，深化兩岸經(jīng)濟(jì)互利合作，維護(hù)兩岸關(guān)系和平發(fā)展，振興中華民族經(jīng)濟(jì)”的宗旨，在國務(wù)院臺(tái)辦和有關(guān)部委的指導(dǎo)和支持下，廣泛團(tuán)結(jié)島內(nèi)經(jīng)濟(jì)界人士，建立有效對(duì)話機(jī)制，積極推進(jìn)兩岸企業(yè)合作、產(chǎn)業(yè)融合發(fā)展，為推動(dòng)兩岸經(jīng)濟(jì)社會(huì)融合發(fā)展做了大量的工作，受到兩岸產(chǎn)經(jīng)各界的積極肯定。特別是在當(dāng)前兩岸關(guān)系形勢更趨嚴(yán)峻復(fù)雜的背景下，峰會(huì)在促進(jìn)兩岸關(guān)系和平發(fā)展、融合發(fā)展，增強(qiáng)臺(tái)胞臺(tái)企在大陸發(fā)展信心等方面發(fā)揮了重要平臺(tái)作用。自2013年至2021年，在南京、臺(tái)北、廈門、金門等地成功舉辦了九次峰會(huì)年會(huì)。主辦和支持各省市舉辦經(jīng)貿(mào)交流活動(dòng)。第十八屆中共中央政治局常委、全國政協(xié)主席俞正聲出席了2013年、2015年、2016年和2017年舉辦的四次年會(huì)并發(fā)表了重要講話。第十九屆中共中央政治局常委、第十三屆全國政協(xié)主席汪洋出席了2018年和2019年峰會(huì)年會(huì)并發(fā)表了重要講話。代表中共中央和習(xí)近平總書記給2020年和2021年峰會(huì)年會(huì)的召開發(fā)來賀信。